O Comitê de Ética em Pesquisa (CEP) da FZEA/USP, foi instituído em 08/10/2008 pelo diretor Prof. Dr. Holmer Savastano. É composto por dois subcolegiados: CEPH – Comitê de Ética em Pesquisa com Seres Humanos (cujas submissões devem ser realizadas através da Plataforma Brasil) e CEUA – Comissão de Ética no Uso de Animais.

Os subcolegiados apresentam protocolos e rotinas distintas de análise ética e se reúnem simultaneamente como CEUA /CEPH-FZEA uma vez por mês, para emissão dos pareceres solicitados no período.